Repository Mirror for your Cloud Server and Webhosting

Title:

International Classification of Diseases 'ICD-10'/'ICD-11' for Chile

Version:

1.0.0

Description:

Tools for working with the International Classification of Diseases ('ICD-10' Chile official 'MINSAL'/'DEIS' v2018). Includes optimized 'SQL' search with 'SQLite', fuzzy matching of medical terms ('Jaro-Winkler'), Charlson and Elixhauser comorbidity calculation, 'WHO' 'ICD-11' 'API' integration, and hierarchical code validation. Data from Centro FIC Chile 'DEIS' https://deis.minsal.cl/centrofic/.

License:

MIT + file LICENSE

Encoding:

UTF-8

LazyData:

true

Depends:

R (≥ 4.1.0)

Imports:

DBI, RSQLite, stringdist, stringr, dplyr, tibble, tools, utils, lifecycle, rlang, httr2, cli (≥ 3.6.0)

Suggests:

comorbidity, gt, readxl, vcr (≥ 2.0.0), withr, testthat (≥ 3.3.0), knitr, rmarkdown

VignetteBuilder:

knitr

URL:

https://docs.ropensci.org/ciecl/, https://github.com/ropensci/ciecl

BugReports:

https://github.com/ropensci/ciecl/issues

Config/testthat/edition:

Config/Needs/website:

pkgdown, vcr

Language:

en, es

Config/roxygen2/version:

8.0.0

NeedsCompilation:

Packaged:

2026-10-02 13:36:41 UTC; tassu

Author:

Rodolfo Tasso Suazo

[aut, cre] (Grupo de Ciencia de Datos para Salud Pública, Escuela de Salud Pública, U. de Chile), Francisca Jofre [ctb] (Package logo design), Maëlle Salmon [rev] (Maëlle reviewed the package (v. 0.9.8) for rOpenSci, see <https://github.com/ropensci/software-review/issues/765>), Yanina Bellini [rev] (Yanina reviewed the package (v. 0.9.8) for rOpenSci, see <https://github.com/ropensci/software-review/issues/765>)

Maintainer:

Rodolfo Tasso Suazo <rtasso@uchile.cl>

Repository:

CRAN

Date/Publication:

2026-10-02 16:00:14 UTC

ciecl: International Classification of Diseases 'ICD-10'/'ICD-11' for Chile

Description

Author(s)

Maintainer: Rodolfo Tasso Suazo rtasso@uchile.cl (ORCID) (Grupo de Ciencia de Datos para Salud Pública, Escuela de Salud Pública, U. de Chile)

Authors:

Rodolfo Tasso Suazo rtasso@uchile.cl (ORCID) (Grupo de Ciencia de Datos para Salud Pública, Escuela de Salud Pública, U. de Chile)

Other contributors:

Francisca Jofre (Package logo design) [contributor]
Maëlle Salmon (Maëlle reviewed the package (v. 0.9.8) for rOpenSci, see <https://github.com/ropensci/software-review/issues/765>) [reviewer]
Yanina Bellini (Yanina reviewed the package (v. 0.9.8) for rOpenSci, see <https://github.com/ropensci/software-review/issues/765>) [reviewer]

Dataset CIE-10 Chile oficial MINSAL/DEIS v2018

Description

Catálogo completo de diagnósticos CIE-10 en versión chilena (MINSAL/DEIS 2018), incluyendo categorías, subcategorías y metadatos jerárquicos. Contiene 39,877 filas que abarcan la totalidad de códigos del sistema de clasificación.

Usage

cie10_cl

Format

Un tibble con 39,877 filas y 11 columnas:

codigo: character. Código CIE-10 alfanumérico (p. ej. "E11.0", "A00", "Z99.9"). Incluye tanto categorías de 3 caracteres como subcategorías con decimal.
descripcion: character. Denominación del diagnóstico en español según terminología oficial MINSAL/DEIS.
categoria: character. Código de categoría de 3 caracteres al que pertenece la fila (p. ej. "E11" para el código "E11.0"). Igual a codigo cuando la propia fila es una categoría.
seccion: character. Rango de categorías que define la sección dentro del capítulo (p. ej. "E10-E14").
capitulo_nombre: character. Nombre descriptivo del capítulo CIE-10 (p. ej. "Enfermedades endocrinas, nutricionales y metabólicas").
inclusion: character. Términos de inclusión asociados al código, tal como figuran en el catálogo oficial. NA cuando no aplica.
exclusion: character. Términos de exclusión (notas "Excl.") asociados al código. NA cuando no aplica.
capitulo: character. Letra o rango que identifica el capítulo CIE-10 (valores "A" a "Z").
es_daga: logical. TRUE si el código es daga (†), es decir, etiología en un par daga/asterisco. FALSE en caso contrario.
es_cruz: logical. TRUE si el código es asterisco (*), es decir, manifestación en un par daga/asterisco. FALSE en caso contrario.
uso_cl: character. Categoría de uso clínico del código según el catálogo MINSAL/DEIS: "principal", "legado", "causa_externa", "etiologico", o la combinación "causa_externa | principal". El valor "legado" identifica códigos sin uso clínico vigente en Chile.

Source

https://deis.minsal.cl/centrofic/

Examples

data(cie10_cl)
head(cie10_cl)

# Códigos vigentes de uso clínico en Chile (excluye categoría "legado")
subset(cie10_cl, uso_cl != "legado") |> nrow()

# Capítulos disponibles
unique(cie10_cl$capitulo)

Limpiar caché SQLite local (forzar rebuild)

Description

ciecl construye, en el primer uso, un archivo SQLite (cie10.db) a partir del dataset cie10_cl y lo guarda en una carpeta de datos del usuario (ver tools::R_user_dir("ciecl", "data")). Esa "caché" evita reconstruir la base en cada sesión. Esta función la elimina y fuerza que la próxima consulta (cie_search(), cie_lookup(), cie10_sql(), etc.) la reconstruya desde cero.

No es necesario llamarla tras actualizar el paquete: la caché guarda la versión del paquete con que se construyó (tabla cie10_meta) y, si la versión cambió, se reconstruye automáticamente en el primer uso. Los casos en que conviene forzar el rebuild manual son: (1) se sospecha que el archivo .db está corrupto (errores de lectura SQL inesperados), o (2) se quiere liberar el espacio en disco que ocupa la caché.

Usage

cie10_clear_cache()

Value

Sin valor de retorno, se llama por sus efectos secundarios (elimina la caché SQLite).

Examples

# Ver ubicación de la caché
tools::R_user_dir("ciecl", "data")


cie10_clear_cache() # Elimina cie10.db local

Cerrar conexión pooled SQLite

Description

ciecl mantiene una única conexión SQLite reutilizable ("pooled") abierta al archivo cie10.db durante la sesión, en lugar de abrir y cerrar una conexión por cada consulta. Mientras esa conexión está abierta, SQLite mantiene un "lock" (bloqueo) sobre el archivo .db: es la forma en que SQLite evita lecturas/escrituras concurrentes inconsistentes sobre el mismo archivo. Esta función cierra esa conexión y libera el lock.

Solo hace falta llamarla manualmente en dos casos: cuando se va a eliminar o reemplazar el archivo cie10.db por fuera del paquete (por ejemplo, con herramientas del sistema operativo), o al finalizar un proceso batch largo para no dejar el archivo bloqueado. Para usar cie10_clear_cache() no es necesario llamarla antes: esa función ya cierra la conexión pooled internamente. Si no se libera el lock, el archivo .db puede seguir abierto hasta que termine la sesión de R; en la práctica esto rara vez es un problema porque cada sesión de R tiene su propia conexión, pero impide que otro proceso externo (no R) edite el archivo mientras la conexión esté abierta.

Usage

cie10_disconnect()

Value

Sin valor de retorno, se llama por sus efectos secundarios (cierra la conexión SQLite pooled).

Examples

# No hay un ejemplo no interactivo: el objeto de conexion vive en un
# entorno interno del paquete (.ciecl_env) y no es parte de la API
# publica, por lo que no hay nada que inspeccionar desde afuera.


cie10_disconnect()

Ejecutar consultas SQL sobre CIE-10 Chile

Description

Permite ejecutar sentencias SQL de solo lectura sobre la tabla cie10, el mismo dataset que entrega cie10_cl. Útil para consultas que no están cubiertas por cie_search()/cie_lookup() (agregaciones, conteos por capítulo, joins con datos propios cargados en la misma conexión, etc.). Para aprender SQL desde cero puede revisar https://www.w3schools.com/sql/ o la documentación de SQLite (https://www.sqlite.org/lang_select.html).

Usage

cie10_sql(query, close = lifecycle::deprecated())

Arguments

query

String SQL válido SQLite. Soporta SELECT, WHERE, JOIN, FROM, ⁠ORDER BY⁠, ⁠GROUP BY⁠ y HAVING. Por seguridad solo se permiten sentencias SELECT (sin escritura ni múltiples sentencias).

close

Ignorado - la conexión es pooled y se gestiona automáticamente. Será eliminado en una versión futura.

Value

tibble con el resultado de la consulta

Examples

# Buscar diabetes
cie10_sql("SELECT codigo, descripcion FROM cie10 WHERE codigo LIKE 'E11%'")


# Contar por capitulo
cie10_sql("SELECT capitulo, COUNT(*) n FROM cie10 GROUP BY capitulo")

Buscar códigos CIE-11 vía API OMS

Description

Buscar códigos CIE-11 vía API OMS

Usage

cie11_search(
  text,
  api_key = get_icd_api_key(),
  lang = c("es", "en"),
  max_results = 10,
  release = "2024-01",
  texto = lifecycle::deprecated()
)

Arguments

text

String término búsqueda español/inglés

api_key

String opcional, Client ID + Secret OMS separados ":". Por defecto se lee desde la variable de entorno ICD_API_KEY vía get_icd_api_key(). Obtener credenciales en: https://icd.who.int/icdapi

lang

Character, idioma respuesta ("es" o "en")

max_results

Integer, máximo resultados (default 10)

release

Character, versión de release CIE-11 a consultar (default "2024-01"). Ver releases disponibles en la API OMS.

texto

Use text.

Details

Seguridad de la API key

NUNCA escribas la llave literal en tus scripts (p. ej. api_key = "tu_id:tu_secret"): si compartes el código (repositorios, correos, capturas) expondrías tus credenciales de forma accidental.

La vía recomendada es guardar la llave en la variable de entorno ICD_API_KEY, por ejemplo editando ⁠~/.Renviron⁠ con usethis::edit_r_environ(); get_icd_api_key() la lee automáticamente.

El argumento api_key existe solo para circunstancias excepcionales (p. ej. manejar múltiples llaves, o entornos donde no es posible fijar una variable de entorno).

Value

tibble con códigos CIE-11 + títulos o vacío si error

Examples

# Ver parámetros disponibles
args(cie11_search)



# Requiere credenciales OMS gratuitas (https://icd.who.int/icdapi)
cie11_search("depresion mayor")




# Causas frecuentes de egreso en Chile
cie11_search("diabetes mellitus")
cie11_search("hipertension esencial")

Calcular comorbilidades Charlson/Elixhauser para Chile

Description

Calcular comorbilidades Charlson/Elixhauser para Chile

Usage

cie_comorbid(data, id, code, map = c("charlson", "elixhauser"), assign0 = TRUE)

Arguments

data

data.frame con columnas id paciente + codigos CIE-10

id

String nombre columna identificador paciente

code

String nombre columna con codigos CIE-10 (uno por fila)

map

Character, esquema comorbilidad ("charlson" o "elixhauser")

assign0

Logical, asignar 0 si sin comorbilidad (default TRUE)

Value

tibble ancho con scores comorbilidad por paciente

Examples

# Ver documentacion de parametros
args(cie_comorbid)


df <- data.frame(
  id_pac = c(1, 1, 2, 2),
  diag = c("E11.0", "I21.0", "C50.9", "E10.9")
)
cie_comorbid(df, id = "id_pac", code = "diag", map = "charlson")

Obtener descripción de códigos CIE-10 (vector)

Description

Devuelve un vector character con la descripción de cada código, pensado para usar dentro de dplyr::mutate() sin necesidad de un left_join contra cie10_cl.

Usage

cie_describe(
  codes,
  normalize = FALSE,
  default = NA_character_,
  codigos = lifecycle::deprecated()
)

Arguments

codes

Character vector de códigos CIE-10 (ej. "E11.0", c("E11.0", "I10")).

normalize

Logical, intentar normalizar los códigos antes de buscar la descripción? (default FALSE). Usar TRUE para limpiar formatos (ej. "E110" -> "E11.0"); usar FALSE para auditar la calidad original del registro.

default

Valor devuelto cuando un código no se encuentra en el catálogo. Default NA_character_.

codigos

Use codes.

Value

Character vector del mismo largo que codes con la descripción oficial MINSAL/DEIS. NA_character_ (o default) para códigos sin match.

Examples

# Auditoría: buscar tal cual (E110 no existe sin punto)
cie_describe("E110", normalize = FALSE)

# Rescate: normalizar antes de buscar
cie_describe("E110", normalize = TRUE)


# Uso típico en auditoría VIU (contar fallos de origen)
diags <- c("E11.0", "E110", "I10X", "INVALIDO")
descripciones <- cie_describe(diags, normalize = FALSE)
sum(is.na(descripciones)) # Detecta 3 errores de registro

Expandir código jerárquico (ej. E11 -> E11.0-E11.9)

Description

Expandir código jerárquico (ej. E11 -> E11.0-E11.9)

Usage

cie_expand(code, codigo = lifecycle::deprecated())

Arguments

code

String código padre (ej. "E11")

codigo

Use code.

Value

Character vector con todos los códigos hijos del código padre. Vector vacío si el código no existe en la base de datos.

Examples

cie_expand("E11")

Guía de funciones de búsqueda (deprecated)

Description

Use cie_guide().

Usage

cie_guia_busqueda()

Value

tibble con guía comparativa

Examples

# Deprecated: usar cie_guide()
cie_guia_busqueda()

Guía de funciones de búsqueda CIE-10

Description

Muestra tabla comparativa de cuándo usar cada función de búsqueda.

Usage

cie_guide()

Value

tibble con guia comparativa de funciones de busqueda

Examples

cie_guide()

Búsqueda exacta por código CIE-10

Description

Búsqueda exacta por código CIE-10

Usage

cie_lookup(
  code,
  expand = FALSE,
  normalize = TRUE,
  full_description = FALSE,
  extract = FALSE,
  check_siglas = FALSE,
  include_uso_cl = TRUE,
  only_uso_cl = FALSE,
  codigo = lifecycle::deprecated(),
  expandir = lifecycle::deprecated(),
  normalizar = lifecycle::deprecated(),
  descripcion_completa = lifecycle::deprecated()
)

Arguments

code

Character vector de códigos (ej. "E11", "E11.0", c("E11.0", "Z00")) o rango (ej. "E10-E14"). Acepta vectores. Soporta formatos: con punto (E11.0), sin punto (E110), o solo categoría (E11).

expand

Logical, expandir jerarquía completa (default FALSE)

normalize

Logical, normalizar formato de códigos automáticamente (default TRUE)

full_description

Logical, agregar columna descripcion_completa con formato "CODIGO - DESCRIPCION" (default FALSE)

extract

Logical, extraer código CIE-10 de texto con prefijos/sufijos (default FALSE). IMPORTANTE: Solo usar con código ESCALAR (longitud 1). Ejemplo: "CIE:E11.0" -> "E11.0", "E11.0-confirmado" -> "E11.0". Para vectores múltiples usar extract=FALSE (default).

check_siglas

Logical, buscar siglas médicas comunes (default FALSE). Ejemplo: "IAM" -> I21.0 (Infarto agudo miocardio)

include_uso_cl

Logical, incluir columna uso_cl en el output (default TRUE). El default difiere de cie_search() (FALSE) para preservar el contrato histórico de cada función. Valores posibles: "principal", "legado", "causa_externa", "etiologico", "causa_externa | principal".

only_uso_cl

Logical, filtrar a códigos vigentes de uso clínico en Chile (default FALSE). Cuando es TRUE, excluye los códigos con uso_cl == "legado" (es decir, conserva principal, causa_externa, etiologico y sus combinaciones).

codigo

Use code.

expandir

Use expand.

normalizar

Use normalize.

descripcion_completa

Use full_description.

Value

tibble con codigo(s) matcheado(s)

Examples

# Búsqueda directa por código
cie_lookup("E11.0")


cie_lookup("E110") # Sin punto
cie_lookup("E11") # Solo categoría
cie_lookup("E11", expand = TRUE) # Todos E11.x
# Vectorizado - múltiples códigos y formatos
cie_lookup(c("E11.0", "Z00", "I10"))
# Con descripción completa
cie_lookup("E110", full_description = TRUE)
# Extraer código de texto con ruido (solo código escalar)
cie_lookup("CIE:E11.0", extract = TRUE)
cie_lookup("E11.0-confirmado", extract = TRUE)
# Buscar por siglas médicas
cie_lookup("IAM", check_siglas = TRUE)
cie_lookup("DM2", check_siglas = TRUE)
# Filtrar a códigos vigentes de uso clínico Chile (excluye 'legado')
cie_lookup("E11", expand = TRUE, only_uso_cl = TRUE)
# Omitir columna uso_cl en el output
cie_lookup("E11.0", include_uso_cl = FALSE)

Mapeo manual de grupos de comorbilidad específicos de Chile

Description

Agrupa códigos CIE-10 chilenos en categorías de comorbilidad MINSAL. Basado en Decreto 1301/2016 MINSAL + icd::icd10_map_charlson.

Usage

cie_map_comorbid(codes, codigos = lifecycle::deprecated())

Arguments

codes

Character vector de codigos

codigos

Use codes.

Value

tibble con columnas: codigo, categoria

Examples

cie_map_comorbid(c("E11.0", "I50.9", "C50.9"))

Normalizar códigos CIE-10 a formato con punto

Description

Convierte códigos CIE-10 de diferentes formatos al formato estándar (con punto). Maneja múltiples variaciones de entrada comunes en datos clínicos.

Usage

cie_norm(
  codes,
  search_db = TRUE,
  codigos = lifecycle::deprecated(),
  buscar_db = lifecycle::deprecated()
)

cie_normalize(
  codes,
  search_db = TRUE,
  codigos = lifecycle::deprecated(),
  buscar_db = lifecycle::deprecated()
)

Arguments

codes

Character vector de códigos en cualquier formato

search_db

Logical, buscar código en base de datos si no se encuentra exacto (default TRUE)

codigos

Use codes.

buscar_db

Use search_db.

Details

La normalización incluye:

Conversión a mayúsculas
Eliminación de espacios (inicio, fin e internos)
Eliminación de símbolos daga y asterisco (codificación dual)
Conversión de guiones a puntos (I10-0 -> I10.0)
Eliminación de puntos iniciales (.I10 -> I10)
Corrección de puntos múltiples (E..11 -> E.11)
Eliminación de sufijo X en códigos cortos, incluido el punto previo si lo hay (I10X -> I10, E11.X -> E11)
Preservación de X en códigos largos (placeholder 7o carácter)
Agregado de punto en posición correcta (E110 -> E11.0)

El sistema de daga/asterisco indica codificación dual donde la daga marca la enfermedad subyacente y el asterisco la manifestación. Ambos símbolos se eliminan para normalización.

Value

Character vector con códigos normalizados al formato con punto

Examples

cie_norm("E110")     # Retorna "E11.0"
cie_norm("E11")      # Retorna "E11" (categoría)
cie_norm("I10X")     # Retorna "I10" (elimina X)
cie_norm("E 11 0")   # Retorna "E11.0" (espacios internos)
cie_norm("I10-0")    # Retorna "I10.0" (guion a punto)
cie_norm(paste0("A17.0", intToUtf8(0x2020)))  # "A17.0" (elimina daga)
cie_norm("G01*")                              # "G01"   (elimina asterisco)
cie_norm(c("E110", "I10X", "Z00"))  # Vectorizado

Normalizar códigos CIE-10 (deprecated)

Description

Usage

cie_normalizar(
  codigos = lifecycle::deprecated(),
  buscar_db = lifecycle::deprecated()
)

Arguments

codigos

Character vector de códigos. Use cie_norm() con codes en código nuevo.

buscar_db

Logical, buscar código en DB (default TRUE). Use cie_norm() con search_db en código nuevo.

Details

Alias en español de cie_norm(). Se mantiene por compatibilidad con código existente en CRAN. Usar cie_norm() en código nuevo.

Value

Character vector con códigos normalizados

Examples

# Deprecated: usar cie_norm()
cie_normalizar("E110")

Búsqueda difusa (fuzzy) de términos médicos CIE-10

Description

Busca en descripciones CIE-10 usando múltiples estrategias:

Expansión de siglas médicas (IAM, TBC, DM, etc.)
Búsqueda exacta por subcadena (más rápida)
Búsqueda fuzzy con Jaro-Winkler (tolera typos)

Usage

cie_search(
  text,
  threshold = 0.7,
  max_results = 50,
  field = c("descripcion", "inclusion"),
  only_fuzzy = FALSE,
  verbose = TRUE,
  include_uso_cl = FALSE,
  only_uso_cl = FALSE,
  texto = lifecycle::deprecated(),
  campo = lifecycle::deprecated(),
  solo_fuzzy = lifecycle::deprecated()
)

Arguments

text

String término médico en español o sigla (ej. "diabetes", "IAM", "TBC")

threshold

Numeric entre 0 y 1, umbral similitud Jaro-Winkler (default 0.70)

max_results

Integer, máximo resultados a retornar (default 50)

field

Character, campo búsqueda ("descripcion" o "inclusion")

only_fuzzy

Logical, usar solo búsqueda fuzzy sin búsqueda exacta (default FALSE)

verbose

Logical, mostrar mensajes informativos (default TRUE). Usar FALSE en scripts.

include_uso_cl

Logical, incluir columna uso_cl en el output (default FALSE). El default difiere de cie_lookup() (TRUE) para preservar el contrato histórico de cada función. Valores posibles: "principal", "legado", "causa_externa", "etiologico", "causa_externa | principal".

only_uso_cl

Logical, filtrar a códigos vigentes de uso clínico en Chile (default FALSE). Cuando es TRUE, excluye los códigos con uso_cl == "legado".

texto

Use text.

campo

Use field.

solo_fuzzy

Use only_fuzzy.

Details

La búsqueda es tolerante a tildes: "neumonia" (sin tilde) encuentra "neumonía" (con tilde) en el catálogo. Soporta siglas médicas comunes: "IAM" busca "infarto agudo miocardio".

Value

tibble ordenado por score descendente (1.0 = coincidencia exacta). Si el text corresponde a una sigla médica, se expande automáticamente antes de buscar.

Examples

# Búsqueda básica
cie_search("diabetes")


cie_search("neumonia")

# Búsqueda por siglas médicas
cie_search("IAM")
cie_search("DM2")

# Tolerante a tildes y typos
cie_search("diabetis")

# Buscar en inclusiones
cie_search("bacteriana", field = "inclusion")
# Filtrar a códigos vigentes Chile (excluye 'legado')
cie_search("diabetes", only_uso_cl = TRUE)
# Mostrar la columna uso_cl en el output
cie_search("diabetes", include_uso_cl = TRUE)

Listar siglas médicas soportadas

Description

Muestra todas las siglas médicas que pueden usarse en cie_search(). "Sigla" se conserva como término local (concepto médico chileno) en la columna de salida; el nombre de la función usa cie_short por consistencia con el ecosistema R (verbos cortos en inglés).

Usage

cie_short(category = NULL, categoria = lifecycle::deprecated())

Arguments

category

Character opcional, filtrar por categoría. Los valores (sin tildes, son tokens usados también para matching interno) son: "cardiovascular", "respiratoria", "metabolica", "gastrointestinal", "infecciosa", "oncologica", "reumatologica", "neurologica", "psiquiatrica", "traumatologica", "pediatrica", "gineco_obstetrica". Si es NULL (default), retorna todas las siglas.

categoria

Use category.

Value

tibble con columnas: sigla, termino_busqueda, categoria

Examples

# Ver todas las siglas
cie_short()

# Filtrar por categoría
cie_short("cardiovascular")
cie_short("oncologica")

# Buscar una sigla específica
cie_short() |> dplyr::filter(sigla == "iam")

Listar siglas médicas (deprecated)

Description

Use cie_short().

Usage

cie_siglas(categoria = NULL)

Arguments

categoria

Character opcional, filtrar por categoría

Value

tibble con columnas: sigla, termino_busqueda, categoria

Generar tabla HTML interactiva GT de código CIE-10

Description

Muestra la jerarquía de un código CIE-10 (categoría + subcategorías) como una tabla gt. Las columnas "Incluye" y "Excluye" pueden aparecer vacías en subcategorías: el catálogo MINSAL/DEIS no puebla esos campos en todos los niveles (suelen estar solo en la categoría de 3 dígitos). Para evitar confusión visual, los NA se reemplazan por un guion largo (em dash).

Usage

cie_table(code, codigo = lifecycle::deprecated())

Arguments

code

String código de longitud 1, un solo código (ej. "E11" muestra la jerarquía).

codigo

Use code.

Value

Objeto de clase gt_tbl (tabla HTML interactiva).

Examples


cie_table("E11")  # Diabetes mellitus tipo 2 completo

Validar vector de códigos CIE-10 formato

Description

Validar vector de códigos CIE-10 formato

Usage

cie_validate_vector(codes, strict = FALSE, codigos = lifecycle::deprecated())

Arguments

codes

Character vector códigos (ej. c("E11.0", "Z00.0"))

strict

Logical, validar existencia en DB (default FALSE)

codigos

Use codes.

Value

Logical vector de la misma longitud que codes. TRUE si el código tiene formato CIE-10 válido (y existe en DB si strict = TRUE).

Examples

cie_validate_vector(c("E11.0", "INVALIDO", "Z00"))

Obtener la API key de la OMS desde el entorno

Description

Lee la variable de entorno ICD_API_KEY y aborta con un error informativo si no está configurada. Es el valor por defecto del argumento api_key de cie11_search(), siguiendo el patrón recomendado por httr2 para envolver APIs.

Usage

get_icd_api_key()

Details

Configura la variable editando ⁠~/.Renviron⁠ con usethis::edit_r_environ():

ICD_API_KEY=tu_client_id:tu_client_secret

Nunca escribas la llave literal en scripts que vayas a compartir.

Value

String con la API key en formato "client_id:client_secret".

Examples

# Requiere ICD_API_KEY configurada (ver Details)
try(get_icd_api_key())

Package {ciecl}

ciecl: International Classification of Diseases 'ICD-10'/'ICD-11' for Chile

Description

Author(s)

See Also

Dataset CIE-10 Chile oficial MINSAL/DEIS v2018

Description

Usage

Format

Source

See Also

Examples

Limpiar caché SQLite local (forzar rebuild)

Description

Usage

Value

See Also

Examples

Cerrar conexión pooled SQLite

Description

Usage

Value

See Also

Examples

Ejecutar consultas SQL sobre CIE-10 Chile

Description

Usage

Arguments

Value

See Also

Examples

Buscar códigos CIE-11 vía API OMS

Description

Usage

Arguments

Details

Seguridad de la API key

Value

See Also

Examples

Calcular comorbilidades Charlson/Elixhauser para Chile

Description

Usage

Arguments

Value

See Also

Examples

Obtener descripción de códigos CIE-10 (vector)

Description

Usage

Arguments

Value

See Also

Examples

Expandir código jerárquico (ej. E11 -> E11.0-E11.9)

Description

Usage

Arguments

Value

See Also

Examples

Guía de funciones de búsqueda (deprecated)

Description

Usage

Value

See Also

Examples

Guía de funciones de búsqueda CIE-10

Description

Usage

Value

See Also

Examples

Búsqueda exacta por código CIE-10

Description

Usage

Arguments

Value

See Also

Examples