CRAN Package Check Results for Package SCIntRuler

Last updated on 2025-07-11 17:48:36 CEST.

Flavor	Version	Tinstall	Tcheck	Ttotal	Status	Flags
r-devel-linux-x86_64-debian-clang	0.99.6	54.33	459.69	514.02	ERROR
r-devel-linux-x86_64-debian-gcc	0.99.6	41.45	332.72	374.17	ERROR
r-devel-linux-x86_64-fedora-clang	0.99.6			789.15	ERROR
r-devel-linux-x86_64-fedora-gcc	0.99.6			746.81	ERROR
r-devel-windows-x86_64	0.99.6	55.00	401.00	456.00	OK
r-patched-linux-x86_64	0.99.6	53.54	438.03	491.57	ERROR
r-release-linux-x86_64	0.99.6	49.84	456.46	506.30	OK
r-release-macos-arm64	0.99.6			232.00	OK
r-release-macos-x86_64	0.99.6			417.00	OK
r-release-windows-x86_64	0.99.6	57.00	390.00	447.00	ERROR
r-oldrel-macos-arm64	0.99.6			233.00	OK
r-oldrel-macos-x86_64	0.99.6			575.00	OK
r-oldrel-windows-x86_64	0.99.6	76.00	553.00	629.00	OK

Check Details

Version: 0.99.6
Check: re-building of vignette outputs
Result: ERROR Error(s) in re-building vignettes: ... --- re-building ‘SCIntRuler.Rmd’ using rmarkdown Performing log-normalization 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Calculating gene variances 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Calculating feature variances of standardized and clipped values 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| | | | 0% | |======================= | 33% | |=============================================== | 67% | |======================================================================| 100% 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| The magick package is required to crop "/home/hornik/tmp/R.check/r-devel-clang/Work/PKGS/SCIntRuler.Rcheck/vign_test/SCIntRuler/vignettes/SCIntRuler_files/figure-html/UMAP -1.png" but not available. The magick package is required to crop "/home/hornik/tmp/R.check/r-devel-clang/Work/PKGS/SCIntRuler.Rcheck/vign_test/SCIntRuler/vignettes/SCIntRuler_files/figure-html/UMAP2 -1.png" but not available. 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Quitting from SCIntRuler.Rmd:166-200 [integration] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ NULL ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'SCIntRuler.Rmd' failed with diagnostics: `grobs` must be a single grob or a list of grobs, not a list. --- failed re-building ‘SCIntRuler.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘SCIntRuler.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted Flavor: r-devel-linux-x86_64-debian-clang

Version: 0.99.6
Check: re-building of vignette outputs
Result: ERROR Error(s) in re-building vignettes: ... --- re-building ‘SCIntRuler.Rmd’ using rmarkdown Performing log-normalization 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Calculating gene variances 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Calculating feature variances of standardized and clipped values 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| | | | 0% | |======================= | 33% | |=============================================== | 67% | |======================================================================| 100% 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| The magick package is required to crop "/home/hornik/tmp/R.check/r-devel-gcc/Work/PKGS/SCIntRuler.Rcheck/vign_test/SCIntRuler/vignettes/SCIntRuler_files/figure-html/UMAP -1.png" but not available. The magick package is required to crop "/home/hornik/tmp/R.check/r-devel-gcc/Work/PKGS/SCIntRuler.Rcheck/vign_test/SCIntRuler/vignettes/SCIntRuler_files/figure-html/UMAP2 -1.png" but not available. 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Quitting from SCIntRuler.Rmd:166-200 [integration] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ NULL ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'SCIntRuler.Rmd' failed with diagnostics: `grobs` must be a single grob or a list of grobs, not a list. --- failed re-building ‘SCIntRuler.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘SCIntRuler.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted Flavor: r-devel-linux-x86_64-debian-gcc

Version: 0.99.6
Check: re-building of vignette outputs
Result: ERROR Error(s) in re-building vignettes: --- re-building ‘SCIntRuler.Rmd’ using rmarkdown Performing log-normalization 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Calculating gene variances 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Calculating feature variances of standardized and clipped values 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| | | | 0% | |======================= | 33% | |=============================================== | 67% | |======================================================================| 100% 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| The magick package is required to crop "/data/gannet/ripley/R/packages/tests-clang/SCIntRuler.Rcheck/vign_test/SCIntRuler/vignettes/SCIntRuler_files/figure-html/UMAP -1.png" but not available. The magick package is required to crop "/data/gannet/ripley/R/packages/tests-clang/SCIntRuler.Rcheck/vign_test/SCIntRuler/vignettes/SCIntRuler_files/figure-html/UMAP2 -1.png" but not available. 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Quitting from SCIntRuler.Rmd:166-200 [integration] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ NULL ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'SCIntRuler.Rmd' failed with diagnostics: `grobs` must be a single grob or a list of grobs, not a list. --- failed re-building ‘SCIntRuler.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘SCIntRuler.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted Flavor: r-devel-linux-x86_64-fedora-clang

Version: 0.99.6
Check: re-building of vignette outputs
Result: ERROR Error(s) in re-building vignettes: --- re-building ‘SCIntRuler.Rmd’ using rmarkdown Performing log-normalization 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Calculating gene variances 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Calculating feature variances of standardized and clipped values 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| | | | 0% | |======================= | 33% | |=============================================== | 67% | |======================================================================| 100% 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Quitting from SCIntRuler.Rmd:166-200 [integration] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ NULL ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'SCIntRuler.Rmd' failed with diagnostics: `grobs` must be a single grob or a list of grobs, not a list. --- failed re-building ‘SCIntRuler.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘SCIntRuler.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted Flavor: r-devel-linux-x86_64-fedora-gcc

Version: 0.99.6
Check: re-building of vignette outputs
Result: ERROR Error(s) in re-building vignettes: ... --- re-building ‘SCIntRuler.Rmd’ using rmarkdown Performing log-normalization 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Calculating gene variances 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Calculating feature variances of standardized and clipped values 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| | | | 0% | |======================= | 33% | |=============================================== | 67% | |======================================================================| 100% 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| The magick package is required to crop "/home/hornik/tmp/R.check/r-patched-gcc/Work/PKGS/SCIntRuler.Rcheck/vign_test/SCIntRuler/vignettes/SCIntRuler_files/figure-html/UMAP -1.png" but not available. The magick package is required to crop "/home/hornik/tmp/R.check/r-patched-gcc/Work/PKGS/SCIntRuler.Rcheck/vign_test/SCIntRuler/vignettes/SCIntRuler_files/figure-html/UMAP2 -1.png" but not available. 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Quitting from SCIntRuler.Rmd:166-200 [integration] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ NULL ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'SCIntRuler.Rmd' failed with diagnostics: `grobs` must be a single grob or a list of grobs, not a list. --- failed re-building ‘SCIntRuler.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘SCIntRuler.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted Flavor: r-patched-linux-x86_64

Version: 0.99.6
Check: re-building of vignette outputs
Result: ERROR Error(s) in re-building vignettes: --- re-building 'SCIntRuler.Rmd' using rmarkdown Performing log-normalization 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Calculating gene variances 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Calculating feature variances of standardized and clipped values 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| | | | 0% | |======================= | 33% | |=============================================== | 67% | |======================================================================| 100% 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| The magick package is required to crop "D:/RCompile/CRANpkg/local/4.5/SCIntRuler.Rcheck/vign_test/SCIntRuler/vignettes/SCIntRuler_files/figure-html/UMAP -1.png" but not available. The magick package is required to crop "D:/RCompile/CRANpkg/local/4.5/SCIntRuler.Rcheck/vign_test/SCIntRuler/vignettes/SCIntRuler_files/figure-html/UMAP2 -1.png" but not available. 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Using method 'umap' 0% 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100% [----|----|----|----|----|----|----|----|----|----| **************************************************| Quitting from SCIntRuler.Rmd:166-200 [integration] ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ NULL ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Error: processing vignette 'SCIntRuler.Rmd' failed with diagnostics: `grobs` must be a single grob or a list of grobs, not a list. --- failed re-building 'SCIntRuler.Rmd' SUMMARY: processing the following file failed: 'SCIntRuler.Rmd' Error: Vignette re-building failed. Execution halted Flavor: r-release-windows-x86_64