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Yupana

Flavio Lozano-Isla

Yupana es una heramienta interactiva que permite el análisis y gráfica de datos basados en diseños experimentales (Table 1).

Base de datos

Los datos deben estar organizado en formato tidy-data.

Tener en cuenta algunas consideraciones:

No usar caracteres extraños en la cabeceras, e.i.: %, #, &, $, °, !, ^, etc
Los datos deben iniciar en la primera fila y columna, e.i. A1
Evitar usar espacio entre los nombres de las variables, en reemplazo pueden usar “_” o “.”

Las columnas que esten entre corchetes “[]” serán excluidas del análisis

Módulos

Table 1: Módulos de la aplicación Yupana
Modules	Description
Intro	Página principal con la presentación de la aplicación. Interface para insertar el url del la hoja que se va analizar. Opciones para configurar el nombre del libro de campo (Fieldbook data) y la información resumen (Fieldbook summary).
Fieldbook	Incluye dos sub módulos (1) Summary, para insertar los parámetros de acuerdo al diseño experimental de la base de datos. (2) Reshape, para reformar base de datos que se realizaron con la aplicación `Tarpuy`
Analysis	Incluye tres sub módulos (1) Modelo, análisis y diagnósticos de las variables de acuerdo al modelo seleccionado en el módulo `Fieldbook`, puede cambiarse las opciones de forma directa en la hoja `fbsm`. (2) Diagnostic, modulo para observar los supuestos estadísticos y la distribución de los datos. (3) Gsheet, para visualizar la hoja `fbsm` para modificar los parámetros
Graphics	Incluye dos sub módulos (1) Plots, gráfico de las variables exportadas en la hoja de cálculo. (2) Gsheet, para visualizar la hoja con la tabla del gráfico y modificar los parámetros
Multivariate	Incluye tres sub módulos (1) PCA, selección de la variables para resumen de los datos y análisis de componentes principales. (2) HCPC, Análisis de cluster de los individuos. (3) CORR, correlación de las variables numéricas de la base de datos

Graphics

Los parámetros de los gráficos generados en la app pueden ser guardadas en hojas de cálculo de google y luego pueden ser cargadas (Table 2).

Opciones de gráfico

Table 2: Lista de argumentos, descripción y opciones para la generación de gráficos en la aplicación Yupana
arguments	description	options
type	Tipo de gráfico	bar - line
x	Factor en el eje X	`columna tabla`
y	Variable numérica	`columna tabla`
groups	Factor de agrupación	`columna tabla`
xlab	Título eje X	`texto manual`
ylab	Título eje Y	`texto manual`
glab	Título de los grupos	`texto manual`
ylimits	Limites del eje Y (`iniciofinalquiebres`)	`texto manual`
xrotation	Rotación de etiquetas del eje X (`angulohorizontalvertical`)	`texto manual`
sig	Factor o variables para el texto de significancia	`columna tabla`
error	Barra de error: error estándar o desviación estandar	ste - std
xtext	Etiquetas del eje X (separado por comas “,”)	`texto manual`
gtext	Etiquetas de la leyenda (separado por comas “,”)	`texto manual`
legend	Posición de la leyenda	top - left - right - bottom - none
dimensions	Dimensión de la imagen en centímetros (`largoaltodpi`)	`texto manual`
opt	Agregar capas adicionales. e.g. coord_flip(), theme_minimal()	`texto manual`

Nota: Opciones basadas en la función: plot_smr()

Argumentos y valores

Figure 1: Parámetros en {arguments} y {values} para la generación de gráficos en la aplicación Yupana.

Figure 2: Figura basada en los {arguments} y {values} de la tabla anterior.

La apliación por defecto genera un gama de colores {colors} en una escala de grises. Los colores pueden ser modificados de forma manual por sus nombres en ingles o usando los valores HEX. En este caso se cambió la escala de grises por los colores verde (green) y rojo (red) (Figure 1, 2).

Incluir nuevas capas `opt`

Yupana a partir de la versión 0.2.0 permite la inclusión de capas adicionales a los gráficos. Puedes incluir dicha información en opt de los {arguments} (Figure 3, 4).

Puedes incluir diversas capas descritas para el paquete ggplot2.

Figure 3: Gráfico con la inclusión de la capa facet_grid()

$Inclusión de `facet_grid(tratamiento ~ .)` en `opt` de los `{arguments}` en Yupana.$

Figure 4: Inclusión de facet_grid(tratamiento ~ .) en opt de los {arguments} en Yupana.

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